Фамилия Михайлиди имеет греческое происхождение. В современном греческом языке ей соответствует форма Μιχαηλίδης — Михаилидис. В русскоязычной традиции встречаются варианты написания Михайлиди и Михаилиди.

В основе фамилии лежит личное имя Михаил — по-гречески Μιχαήλ. Суффикс -ίδης исторически использовался в греческом языке для образования патронимических имён и фамилий, указывавших на происхождение от отца или предка.

Поэтому наиболее точное этимологическое значение фамилии Михайлиди — «сын Михаила», «потомок Михаила» или «из рода Михаила».

Само имя Михаил восходит к древнееврейскому выражению «Кто как Бог?». Это риторический вопрос, смысл которого состоит в том, что никто не может быть равен Богу.

Фамилии с суффиксом -ίδης встречаются в разных частях греческого мира. Однако по одному окончанию фамилии нельзя надёжно определить место возникновения конкретной семейной ветви или утверждать, что все носители фамилии Михайлиди происходят от одного общего предка.

Одинаковая патронимическая фамилия могла независимо закрепиться в нескольких семьях, предками которых были разные люди по имени Михаил. Применительно к фамилии Михайлиди это пока следует рассматривать как обоснованное предположение, которое требует проверки по историческим и архивным источникам.

Таким образом, языковое значение фамилии можно определить достаточно уверенно, тогда как историю каждой семейной ветви необходимо восстанавливать отдельно — по архивным документам, церковно-метрическим и гражданским записям, переписям, семейным фотографиям, письмам и воспоминаниям.

Именно этому поиску посвящён проект «Михайлиди России»: отделять подтверждённые сведения от семейных преданий, находить связи между поколениями и постепенно создавать документальную историю семей, носящих одну фамилию.